故事发生在神世纪300年，主要讲述结城友奈是初中2年级学生，她天天在学校里过着与很多朋友一同听课、进行社团活动、玩耍的平稳生活。不管怎么看这都是非常普通的女孩的生活日程，但是只有一点与其他孩子决定性不同的地方，那就是她所属的名为“勇者部”的社团活动。以部长犬吠埼风为中心的该社团的活动内容与被谜团包围的叫做Vertex的不可思议的存在有关系，本作正是以描写友奈等人的“勇者部”的活动为主。

很久以前，那还是人类憧憬宇宙，满溢着开拓精神的时代。世界各国在太阳系各行星建设了新的都市，众多的人们在那里安定地度日。在火星上建造的日本新都道府县之一，“第4东京都”。在这个都市的经济特区“雾科市”有着以航空宇宙事业闻名的超一流企业“雾科公司”。这个公司在各种领域扩展市场，也运营着名为“雾科科学技术学园”的私立学校。仅仅如此便已经很特殊了，但学园内还有着更加大放异彩的班级。白天在学园以学生身份努力学习，放学后以职员身份到公司上班，参与名为发展型试作火箭开发的重要项目。那就是“雾科公司先行技术开发部教育开发

在同学的眼中，立石亚由（雪乃五月配音）是一个长相漂亮学习优秀的万能美少女，个性有些冷淡又酷酷的她成为了学妹们心目中的偶像。可是实际上，亚由其实是一个非常普通的女孩子，和所有的青春期女孩一样，她也有着她的梦中情人——对所有人都很和蔼温柔的架地哲士（神谷浩史配音）。作为亚由的朋友，佐仓仁菜（神田朱未配音）将这一切都看在眼中，单纯善良的仁菜决定，利用自己能够使用魔法这一优势，来帮助亚由向架地告白。可是，仁菜菜鸟级别的魔法水平帮了倒忙，竟将告白魔法施展到了架第的好友辻合宏基（千叶进步配音）的身上，多亏有同行桐岛由