辛普森一家是来自美国普通的五口之家，荷马（丹•卡斯泰兰尼塔DanCastellaneta配音）是春田镇核能工厂的安全检查员，母亲马芝（朱莉•卡夫娜JulieKavner配音）曾经是一个很有思想的女性，自从嫁给荷马后渐渐地适应了主妇生活的定式。巴特（南茜•卡特莱特NancyCartwright配音）是家中的长子，天性顽皮的巴特经常爱玩一些恶作剧，以至于经常惹麻烦。妹妹丽莎（雅德丽•史密斯YeardleySmith配音）是一个很聪明的孩子，同时还是素食主义者，佛教徒，爵士乐。小女马姬是一个永远长不大的孩子。故

故事发生在第一部的四年之后，此时特警K（汤姆•李•琼斯饰）已经退休，成为一名普通的邮局局长，而J（威尔•史密斯饰）则继续从事MIB的工作。卡洛瑟星邪恶女王蛇莲娜来到地球需找宇宙能量“萨塔之星”，占领了MIB的总部。而当年逃亡到地球的萨塔公主萝娜曾请求MIB把“萨塔之星”藏在地球，全面负责这件事情的K为了地球的安全，拒绝了她。面对来势汹汹的蛇莲娜，MIB派J去寻找k，调查当年事件的真相，怎样说服失去记忆的K相信外星人的存在，成了J面临的第一个难题……