香港特警队督察蓝朗（方中信饰）在侦察一宗重大罪案期间，冒死前去营救被黑社会绑架的女友（蒙嘉慧饰），却反遭陷害，被迫停职退出警界。朗只好在海边开设小餐厅，希望过平静的生活。可是黑社会势力并没有放过他。十年後，从澳洲回港的年轻人阿孝（陈宇琛饰）来到海鲜酒家工作，其父当年被蓝朗误杀，而阿孝正要来查明真凶。

法政部的高级化验师TimSir（欧阳震华饰）学识广博，有赖于他高超的物证检验手法，屡破奇案。手下兼好友阿Sam（林文龙饰）亦是一名出色的法医，最近他准备和相恋多年的女友汀汀（钟嘉欣饰）正准备结婚。阿Sam的好友Ivan（郑嘉颖饰）刚从英国回来，在一次炸弹危机中安全引爆了炸弹了，令到TimSir对他另眼相看。这时，扫毒组的高级督察马帼英（佘诗曼饰）和一班手下正在追查香港大毒枭戴贵，戴贵逼走了香港的另一个毒枭石头勇而独霸了整个香港市场。正当扫毒组和法证组合力追寻到戴贵的手下和国外毒贩交易，准备将得意洋洋的戴贵

少林武僧火新（元彪饰）本是香港一名神勇干探，因数年轻妻子带着女儿离开了他，加上在查案时误杀了一名青年，他一时看不开来到了少林寺出家。现在，火新和一班师兄弟回到了香港进行巡回表演，恰巧这时，一系列意想不到的命案发生了。接二连三有人突然浑身发热，发疯似的自残，最后惨死，连火新的前上司和好战友李sir都这样莫名其妙死去。为了查清真相，帮李sir申冤，火新决定留下来查明真相。火新与老友黄保（梁家仁饰）的一个租客（陈豪饰）一同住在黄保的出租房内，火新发现这么租客是一个男妓，但他的通灵感觉告诉他这人以后会和自己经历一

仁和医院高级精神科医生高立仁（方中信饰）在婚礼前痛失为重案组探员的未婚妻莫敏儿（徐子珊饰），随即陷入悲伤中不可自拔，甚至为此辞去工作。却不料就在此时，医院接收了一名声称被幻听所困更涉嫌强奸案的精神分裂患者。对此案不甚关心的高立仁路过案发现场，误打误撞帮助了博安医院法医精神科医生梁启荣（萧正楠饰），并建立亦师亦友的关系。已经在外挂牌行医的连志森（蒋志光饰）担心老友丧妻后萎靡不振的精神状态，多番劝说他重振旗鼓。高立仁也终于决定去博安医院任职。在随后一次同学聚会中，夜总会发生命案，高立仁意外结识了警方卧底林颂恩

1997年，刚刚考上惩教官的张承希（郑嘉颖饰）接到妹妹的求助电话，继父刚才对她意图强奸未遂。压抑多年的希忍不住怒火直接冲到继父与其发生冲突，在抵挡继父还手时失手用扳手将其击晕。由于惊恐匆匆离开的希想不到次日即被警方逮捕，罪名是谋杀继父。上庭作出关键性证供的正是表弟唐立言（郭晋安饰），希被判罪名成立，监禁13年。2007年，希出狱，十年来他一直在等待着问清一个事实：为何唐立言要做假口供。如今的唐立言已经是证言行的老板，在世人眼中是严格追求事实真相不畏强权的正义形象。而希的案底以及暴躁的脾气则让所有亲近的人生

这次故事的舞台发生在海关入境处。作为入境处总入境助理的方浚杰（郭晋安饰）一直以来都安于现状，因为曾经和上司麦启铭（姜大伟饰）发生过冲突，对升值也不再抱有希望。和在深圳相识的内地女子张思敏（姚嘉妮饰）结婚，终于等来了申请成功，本以为就此可以一家团聚的浚杰，却因为大嫂对妻子的排挤，矛盾颇多。为家务事烦恼的浚杰接到了更大噩耗是，妻子居然多年前曾在香港犯案，这让正义感颇强的浚杰无法接受。在妻子离开的过程中，浚杰的同期好友叶安琪（蒙嘉慧饰）对他照顾有加，在这当中，浚杰同安琪的感情在滋长。而后，浚杰又认识了港口管制组